常吃夜宵对人体的肠胃危害最大。人的胃黏膜上皮细胞寿命很短，平均2-3天就要更新再生一次，这个过程一般是在夜间休息时进行的。如果经常吃夜宵，胃肠道就得不到必要的休息，胃黏膜的修复不能顺利进行。而且，吃的夜宵长时间停滞在胃中，会促使胃液大量分泌，对胃黏膜造成刺激，久而久之，极易导致胃黏膜糜烂和溃疡。
此外，吃夜宵很少一个人，常常是一群人热热闹闹地边吃边说，一不小心，就会吃得过多。夜宵吃得过饱会造成胃鼓胀，对肝、胆、胰、肠等器官造成压迫，同时引起大脑活跃，使人难以入睡，从而诱发失眠。由于夜间活动量较少，而一顿丰富的夜宵中含有大量脂肪、蛋白质和碳水化合物，它们得不到消耗，就会被合成为脂肪。在夜间，帮助它们变成脂肪的"脂肪合成酶"，活性为白天的8倍，让脂肪的合成变得更加容易。这些脂肪堆积在腹部和皮下，就会造成肥胖；如果进入肝脏，就会形成脂肪肝；进入胰脏，则会引起胰岛素分泌障碍，进而导致血糖升高。
长期处于熬夜吃夜宵的状态下，人体免疫力还会随之下降，感冒、胃肠感染、过敏等自律神经失调症状也会不期而至。
