鱼体内有两种不饱和脂肪酸：22碳六烯酸（DHA）和20碳五烯酸（EPA），对清理和软化血管、降血脂以及健脑、延缓衰老都非常有好处。DHA和EPA在鱼油中的含量要高于鱼肉，而鱼油又相对集中在鱼头内。从这个意义上讲，多吃鱼头对人的健康的确有益。
正常情况下，鱼头内不会有毒素存在，吃鱼头是安全的。但由于近年来整体环境恶化引致水域和生态植物链污染，加之有的养殖者在饲料里添加化学物质，在一定程度上会使鱼体内的有害物质增加，且难以排出，也蓄积到鱼油相对集中的鱼头中去。
至于说到时下吃鱼头的饮食时尚，沈庭栋认为，鱼头上的肉很少，而鱼肉中的蛋白质含量不仅丰富（高达25％～30％），而且其中易被人体吸收的氨基酸也较多，所以，不少专家都提倡人们，尤其是北方、内陆地区的人们，应尽量多摄入鱼肉制品。
有不少人担心吃鱼头会得寄生虫病，然而时下人们吃鱼头多采用炖、煮、炸等方式，经高温处理后，寄生虫大多都能被杀灭。
